自動化：
成立于1958年，是國內(nèi)首創(chuàng)的第一個自動化系。自動化系十分重視對學(xué)生創(chuàng)新能力的培養(yǎng)，要求學(xué)生具有堅實的數(shù)學(xué)和控制理論基礎(chǔ)，能熟練掌握和應(yīng)用電子、計算機、現(xiàn)代通信技術(shù)，并鼓勵學(xué)生跨學(xué)科選修專業(yè)課程。高年級本科學(xué)生可以進入科研實驗室參加前沿科研項目研究，也可以利用暑期到北京自動化所、沈陽自動化所、合肥智能所、北京聲學(xué)所等科研單位參加大學(xué)生研究計劃。
計算機科學(xué)與技術(shù)：
是中國科技大學(xué)的強勢學(xué)科，不僅具有碩士、博士學(xué)位授予權(quán)，博士后流動站，而且具有增設(shè)二級學(xué)科的自主權(quán)。我國第一臺通用計算機——107機就是在這里誕生的。目前本學(xué)科所轄的計算機軟件與理論、計算機系統(tǒng)結(jié)構(gòu)、計算機應(yīng)用技術(shù)、信息安全四個二級學(xué)科均具有碩士、博士學(xué)位授予權(quán)，其中計算機軟件與理論是國家重點學(xué)科，系統(tǒng)結(jié)構(gòu)是省重點學(xué)科。依托計算機科學(xué)與技術(shù)一級學(xué)科，中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)還成為了教育部和國家計委批準(zhǔn)的首批建立國家示范軟件學(xué)院的單位之一。
物理：
是中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)1958年建校時最早設(shè)置的老系之一，目前物理系有物理學(xué)、應(yīng)用物理學(xué)(凝聚態(tài)物理方向、微電子學(xué)與固體電子學(xué)方向)、光信息科學(xué)與技術(shù)三個本科生專業(yè)，其中凝聚態(tài)物理和光學(xué)還是國家重點學(xué)科。
有中科院量子信息重點實驗室、安徽省光電子科學(xué)與技術(shù)重點實驗室2個院省部級重點實驗室，并且是自然科學(xué)學(xué)術(shù)期刊《低溫物理學(xué)報》的所屬單位。物理系是國家理科基礎(chǔ)科學(xué)研究和人才培養(yǎng)基地及中國科學(xué)院博士生重點培養(yǎng)基地，畢業(yè)生中已有6人當(dāng)選中國科學(xué)院或中國工程院院士。目前每屆本科畢業(yè)生約80%左右的同學(xué)在國內(nèi)外著名學(xué)府繼續(xù)深造，由于專業(yè)基礎(chǔ)過硬，綜合素質(zhì)高，物理系研究生畢業(yè)生受到相關(guān)用人單位的廣泛歡迎，就業(yè)地點多分布在北京、上海等大中型城市以及海內(nèi)外經(jīng)濟發(fā)達地區(qū)。南京大學(xué)重點優(yōu)勢專業(yè)介紹 浙大重點優(yōu)勢專業(yè)介紹
